ウンスを「天の医員」と思い込み、高麗へ連れて行くヨン。わけのわからぬウンスだが、王妃の命を助ければ元の場所に帰すとヨンに言われ、渋々王妃の傷の手当をする。手術を終えたウンスは必死で逃げ出すが、町を彷徨う中、刺客に捉えられてしまう。ウンスを探しに町に出たヨンは、王がいる宿を刺客が襲撃に向かったと知る。

王から国の医仙になってほしいと頼まれたウンスは、天門が閉じてしまったことを知る。一方、ウンスが天から来たことを疑う者がいることを知り、彼女の身の危険を察するヨンだが、傷が癒えず体調は深刻な状態だった。そんな中、ヨンと王の会話を聞いたウンスは、ヨンが悲しい過去を背負って生きていることを知る。

ウンスを助けに行ったヨンは、キ・チョルに王命ではなく恋い慕う人を連れ戻すために来たと告げる。王とウンスの命を賭けているキ・チョルは、ウンスに江華島に幽閉されている先王・慶昌君(キョンチャングン)の病を治すよう話し、ヨンに同行を命じる。兄弟のように親密だった慶昌君のもとに向かわせるキ・チョルの狙いを怪しむヨンだが…。

キ・チョルにより謀反の濡れ衣を着せられ、捕らえられるヨン。牢獄に入れられたヨンは、毒で苦しむ慶昌君を楽にさせようと刺したこと、それをウンスに責められたことを思い出し、苦しむ。一方、ウンスはヨンを助けるため、キ・チョルと取引をすることに。そんなウンスにキ・チョルは、心をくれるならヨンを助けると話す。

千年前の神医の手帳に自分が書いたと思われる文字と自分の名前が残されているのを見て、動揺するウンス。手帳に現代へ戻る手掛かりがあると推測するが、キ・チョルに取り上げられる。一方、ヨンは王の忠臣になり得る在野の人材の名簿を作り上げていた。そんな中、ウンスはヨンにこれまでの礼を告げ、自力で現代に帰ると言い出す。

ウンスの手帳を手に入れるため罠をかけてキ・チョルを待つヨン。決死の覚悟でキ・チョルに立ち向かうが、そんな2人の前にウンスが現れる。命がけでヨンを守ろうとするウンスに、退くしかないキ・チョル。そして、ヨンは死のうとしないでと泣くウンスに、二度と無駄に命は賭けないと誓う。そんなヨンにウンスは、共に戦うパートナーになろうと話す。

ヨンは収賄の疑いが掛けられ、真相が明らかになるまで職務を剥奪される。王の寵愛を受けるヨンを煙たがる重臣たちの計略だった。一方、ウンスは手帳に残された数字から天門が開く時を解こうとしていた。そんなウンスに宮を発つ準備をするよう話すヨン。そして、王による尋問が始まり、かばおうとする王の前でヨンは･･･。

徳興君の策略で皇宮が襲われ、ヨンは王を外へ逃がすことに。まんまと玉座を奪う徳興君。ウンスはヨンが亡くなる夢にうなされ、彼の身に何か起こるのではと不安で仕方ない。手帳に書かれた内容に彼を助ける鍵があるかもしれないと考え、ヨンと共に手帳を持つキ・チョルに会いに行く。だが手帳は徳興君に奪われており…。

徳興君の前でウンスにキスをし、2人の婚儀を阻むヨン。徳興君の命で投獄されるが、禁軍を味方につけていたヨンは脱獄、キ・チョルの襲撃から逃走中の王のもとに向かう。キ・チョルに見放された徳興君は、身を守るため故意にウンスを解放する。ウンスが戻り、安堵するヨンだが、ウンスは徳興君から新たな毒を仕込まれており･･･。

ウンスは岩陰に隠されていた未来の自分からの手紙を発見する。今戻れば王妃を助けることができると書かれた手紙を読み、ヨンを説得して皇宮に戻ろうとするウンス。一方、外出していた王妃が消え、王は激しく動揺する。徳興君の仕業と察するが何の証拠もなく、なすすべがない。そして、ヨンとウンスも王妃がさらわれたことを知る。

近衛隊宿舎が襲撃に遭い、手術器具が盗まれた上、培養中だった最後の解毒薬がダメにされてしまう。自分が死んでしまった後のヨンを思い、胸を苦しめるウンス。そんな中、王はヨンを連れて徳興院がいる征東行省(せいとうこうしょう)に。だが、キ・チョルが徳興院を擁立して政変を起こし、王を守るため戦うヨンは剣を握る手に異常を感じる…。

※ 征東行省:元が高麗に設置した機関。高麗の政治と軍と政を統括する。

ウンスを連れてこいと要求するキ・チョルに、1対1で戦いを臨むヨン。その頃、目を覚ましたウンスは、熱も下がり命が助かったことを知る。だが、ウンスの前にはキ・チョルの手下が現れ、さらわれてしまう。ウンスが消え、天門へと連れて行かれたと察したヨンは、耐えきれず後を追う。そして、ついに彼女を見つけ出すが･･･。